FYI

 

Von: Garcia-Castro, Leyla Jael <ljgarcia@zbmed.de>
Gesendet: Donnerstag, 11. September 2025 10:30
An: nfdi-all@lists.nfdi.de
Betreff: [NFDI-all] Bioschemas talk Monday 15.Sep.2025 at 17:00 CEST - The FAIRSCAPE Digital Commons for Ethical AI in Translational Medicine

 

Dear all at NFDI, 

 

If you are interested in semantics, explainable AI, and biomedical and translational medicine, this Bioschemas talk could be of your interest.

 

What: Bioschemas community call - Invited talk "The FAIRSCAPE Digital Commons for Ethical AI in Translational Medicine"

When: Monday 15.Sep.2025 at 17:00 CEST

Where: See Zoom details below

Who: Tim Clark, University of Virginia School of Medicine, Department of Public Health Sciences

Abstract: Biomedical and translational medicine applications of AI impose strong explainability (XAI) requirements for reliable research results and ethical translation to the clinic. These include a need for robust pre-model XAI to prevent black-boxing of data acquisition and preparation events. FAIRSCAPE is an open-source digital commons platform developed to support these needs in collaboration with University of Virginia and University of California San Diego biomedical researchers as part of the $130M NIH Bridge2AI program.  It provides a digital commons environment in Python implementing the Bridge2AI AI-readiness principles on biomedical datasets and provides ethical FAIRness with deep semantic provenance graphs on components such as datasets, software, computations, runtime parameters, environment and personnel involved in a computational analysis. FAIRSCAPE generates detailed human- and machine-readable biomedical Datasheets using JSON-LD serialized schema.org and Evidence Graph Ontology metadata packaged in RO-Crates, including Croissant and Croissant RAI metadata for direct interface to Kaggle and other AI/ML Ops packages, and provides a rich environment for biomedical AI researchers. Remote client tools provide packaging of these metadata with datasets, or dataset references, and their schemas, for upload to a server running under Kubernetes. Data is held in S3-compliant buckets and metadata is stored in MongoDB. REST APIs are provided along with a REACT-based Web interface to the server and export interfaces to NIH-recommended long-term archives. 

Short bio: Clark’s work intersects several fields, including public health, data science, and neurology. He teaches in Public Health Sciences and Neurology in the School of Medicine, and in the School of Data Science. Clark’s research interests include biomedical informatics, neuroscience, Alzheimer’s Disease and disorders of cognition, knowledge representation and integration, digital commons frameworks, ontologies, FAIR data, FAIR software, FAIR computation, argumentation frameworks, and evidence graphs

Agenda: https://docs.google.com/document/d/1kd5F97ogdiPNhLTnkei-RVR8TC8Ohpc5QSPX3KsfDrk/edit?tab=t.0#heading=h.juzanf5x2abw

 

Zoom details.

Topic: Bioschemas Community Meeting - Tim Clark

Time: Sep 15, 2025 05:00 PM Amsterdam, Berlin, Rome, Stockholm, Vienna

Join Zoom Meeting

Meeting ID: 815 5256 5788

Passcode: 839213

Join instructions (by phone)

 

Kind regards, 

Jael

 

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Dr. Leyla Jael Castro ljgarcia@zbmed.de @ljcastro@fosstodon.org

Semantic Technologies @BibLabs - Team leader 

 

ZB MED – Information Centre for Life Sciences

Gleueler Straße 60

50931 Cologne

 

ljgarcia@zbmed.de

+49 (0)221/999-892529

www.zbmed.de

 

INFORMATION. KNOWLEDGE. LIFE.

 


From: Nathalie Rathgeb <Nathalie.Rathgeb@nfdi.de>
Sent: Wednesday, September 3, 2025 2:49 PM
To: nfdi-all@lists.nfdi.de
Subject: [NFDI-all] NFDITalk (15 Sep): Datenschutz, Wissenschaft und Forschung – Widerspruch oder Chance?

 

 

Datenschutz, Wissenschaft und Forschung – Widerspruch oder Chance?

15 September, 4 PM – Online

 

 

Sprecher: Tino Melzer, Landesdatenschutzbeauftragter für Thüringen

 

Über den Talk:

Der Vortrag auf Deutsch verdeutlicht, wie Datenschutz, Wissenschaft und Forschung zusammenwirken. Er geht auf die datenschutzrechtlichen Bestimmungen zur Forschung ein und zeigt auf, dass Datenschutz die Qualität und Legitimität der Forschung sichert.

Diese NFDITalk-Folge wird gemeinsam mit der Sektion Ethical, Legal & Social Aspects organisiert.

 

Hier geht es zum Zoom Meeting:

https://us02web.zoom.us/j/87966293929?pwd=ME1YSTBhY1NZWHo1bWhtcVFNaFZVQT09

Meeting-ID: 879 6629 3929

Code: 931849

 

Teilen Sie den YouTube stream: https://www.youtube.com/live/ovyXGR5Re_Y

 

 

 

Beste Grüße

 

 

Nathalie Rathgeb

Wissenschaftliche Referentin PR/Kommunikation


Nationale Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) e.V.

Albert-Nestler-Str. 13

76131 Karlsruhe
Tel. +49 721 988 994 20
Mail 
nathalie.rathgeb@nfdi.de  

Web www.nfdi.de

 

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Mitten in der St. Elisabeth Gruppe:

St. Anna Hospital Herne, Marien Hospital Herne – Universitätsklinikum der Ruhr-Universität Bochum,
Marien Hospital Witten, Rheumazentrum Ruhrgebiet, St. Marien Hospital Eickel,
Medizinische Reha für psychische Gesundheit, St. Elisabeth Stift Herne, Senioreneinrichtungen Widumer Höfe,
Gästehaus St. Elisabeth, Ambulante Pflege, MVZ Ärzte – Herne | Wanne | Witten,
Lukas Hospiz Herne, St. Elisabeth Hospiz Witten, Bildungszentrum Ruhr, Bildungswerk,
Campus der St. Elisabeth Gruppe, Kinder in der St. Elisabeth Gruppe

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Aufsichtsratsvorsitzender: Dr. Hans Willmes

Geschäftsführung: Dr. Sabine Edlinger, Simone Lauer

 

Registergericht:

HRB 9735 Amtsgericht Bochum

St.-Nr.: 325/5894/2251

 

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